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--- wiki:docssugg_ut [2022/06/15 20:19]
cnr-guest created
+++ wiki:docssugg_ut [2022/06/28 16:42] (current)
cnr-guest
@@ Line 264: / Line 264: @@
 compilation aborted for gpu.cpp (code 2)
 make[5]: *** [gpu.o] Error 2
-make[5]: Leaving directory `/lustre/home/pamodeo/sw/amber20_src/src/pmemd/src/cuda'
+make[5]: Leaving directory `/lustre/home/<utente>/sw/amber20_src/src/pmemd/src/cuda'
 make[4]: *** [cuda_spfp_libs] Error 2
-make[4]: Leaving directory `/lustre/home/pamodeo/sw/amber20_src/src/pmemd/src'
+make[4]: Leaving directory `/lustre/home/<utente>/sw/amber20_src/src/pmemd/src'
 make[3]: *** [cuda_SPFP] Error 2
-make[3]: Leaving directory `/lustre/home/pamodeo/sw/amber20_src/src/pmemd/src'
+make[3]: Leaving directory `/lustre/home/<utente>/sw/amber20_src/src/pmemd/src'
 make[2]: *** [cuda_serial] Error 2
-make[2]: Leaving directory `/lustre/home/pamodeo/sw/amber20_src/src/pmemd'
+make[2]: Leaving directory `/lustre/home/<utente>/sw/amber20_src/src/pmemd'
 make[1]: *** [cuda_serial] Error 2
-make[1]: Leaving directory `/lustre/home/pamodeo/sw/amber20_src/src'
+make[1]: Leaving directory `/lustre/home/<utente>/sw/amber20_src/src'
 make: *** [amber] Error 2</code>
@@ Line 303: / Line 303: @@
 Purtroppo stavo eseguendo prove durante lo spostamento di conda di stanotte, quindi ho avuto un po' di confusione nell'ambiente. Ora pare sia tutto a posto e sono riuscito a compilare AMBER 20 in conda con i compilatori GNU (dopo downgrade dei compilatori alla versione 10.3, rispetto alla 11.2 installata d'ufficio da conda, per motivi di compatibilità con CUDA 11). Ai primi test, le versioni "seriale" e "seriale + CUDA + OPENMP" funzionano senza problemi. Ora proverò a lanciare job in batch e poi passerò alle versioni parallele.\\
-In ogni caso, sebbene con conda le cose pare stiano cominciando a funzionare, sono lieto di avere i compilatori devtools sia perché è più semplice (anche) fare prove con diverse versioni e combinazioni di compilatori e librerie accessorie, sia perché, comunque, conda "soffre" di alcuni bug persistenti (ogni tanto va in crisi sulle verifiche di conflitti) e della versione datata di glibc installata di sistema.
+In ogni caso, sebbene con conda le cose pare stiano cominciando a funzionare, sono lieto di avere i compilatori devtools sia perché è più semplice (anche) fare prove con diverse versioni e combinazioni di compilatori e librerie accessorie, sia perché, comunque, conda "soffre" di alcuni bug persistenti (ogni tanto va in crisi sulle verifiche di conflitti) e della versione datata di glibc installata di sistema.\\
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